電源提供直流電，在垂直轉(zhuǎn)印電泳槽中產(chǎn)生電場，驅(qū)動帶電分子的遷移。垂直轉(zhuǎn)印電泳槽是電泳系統(tǒng)的核心部分，根據(jù)電泳的原理，電泳支持物都是放在兩個緩沖液之間，電場通過電泳支持物連接兩個緩沖液，不同電泳采用不同的電泳槽。常用的垂直轉(zhuǎn)印電泳槽有：
　　1、垂直板式電泳：制膠和電泳不在電泳管中，而是在塊垂直放置的平行玻璃板中間，常用于聚丙烯酰胺凝膠電泳中蛋白質(zhì)的分離和對少量核酸及蛋白質(zhì)樣品進(jìn)行垂直電泳。垂直轉(zhuǎn)印電泳槽中間是夾在一起的兩塊玻璃板，玻璃板兩邊由塑料條隔開，在玻璃平板中間制備電泳凝膠，凝膠的大小通常是12cm～14cm，厚度為1mm～2mm，制膠時在凝膠溶液中放一個塑料梳子，在膠聚合后移去，形成上樣品的凹槽。垂直轉(zhuǎn)印電泳槽也有不同型號，一般分為小型，中型和大型，差別是凝膠板規(guī)格大小和試樣格齒數(shù)及厚度。
　　2、水平式電泳：凝膠鋪在水平的玻璃或塑料板上，用一薄層濕濾紙連接凝膠和電泳緩沖液，或?qū)⒛z直接浸入緩沖液中。由于pH值的改變會引起帶電分子電荷的改變，進(jìn)而影響其電泳遷移的速度，所以電泳過程應(yīng)在適當(dāng)?shù)木彌_液中進(jìn)行的，緩沖液可以保持待分離物的帶電性質(zhì)的穩(wěn)定。水平式電泳用于對少量或大批量核酸（DNA或RNA）進(jìn)行瓊脂糖電泳。水平電泳槽有不同型號，一般分為迷你型，小號，中號和大號，主要差別同樣是凝膠板規(guī)格大小和試樣格齒數(shù)及厚度。迷你型的試樣格齒數(shù)一般有十齒左右，小號通常6～15齒不等，中號大多三十幾齒，大號可達(dá)48齒。
　　3、等電聚焦多用途垂直轉(zhuǎn)印電泳槽：適合于分離分子量相近而等電點(diǎn)不同的蛋白質(zhì)組分
　　4、轉(zhuǎn)移電泳槽：用來對少量核酸及蛋白質(zhì)樣品進(jìn)行轉(zhuǎn)移電泳的裝置。分為槽式轉(zhuǎn)印，半干轉(zhuǎn)印，微量過濾和篩選，真空轉(zhuǎn)印。槽式轉(zhuǎn)印系統(tǒng)可理想地用于多數(shù)常規(guī)蛋白研究，可靈活選擇電壓設(shè)置，轉(zhuǎn)印時間和冷卻方法。半干轉(zhuǎn)印槽無需緩沖液槽或轉(zhuǎn)印夾就能實(shí)現(xiàn)快速，有效，經(jīng)濟(jì)的轉(zhuǎn)印，zui適于中等分子量大小的蛋白（10-100KD），也能從瓊脂糖凝膠上轉(zhuǎn)印DNA和RNA。微量過濾（或斑點(diǎn)印跡設(shè)備）用于新印跡分析中確定工作條件，或其他不要求凝膠電泳分辨率的應(yīng)用。適于蛋白和核酸的雜交。真空轉(zhuǎn)印能快速而有效的把DNA或RNA從瓊脂糖凝膠轉(zhuǎn)到尼龍膜?？傊梢越Y(jié)合自身需求選擇合適的電泳槽儀器。